Cenote-Taker 3 para el descubrimiento rápido y preciso de virus y la anotación del viroma.
Es una herramienta bioinformática de virus que escala desde secuencias de genomas individuales hasta ensamblajes de metagenomas masivos a:
- Llamadas ORF adaptativas
- Un gran catálogo de HMM de familias de genes de virus para la anotación funcional
- Asignación de taxonomía jerárquica basada en genes distintivos
- Búsqueda de base de datos de CDD basada en mmseqs2
- Salidas tabulares (.tsv) y de mapa del genoma interactivo (.gbf)
Licencia MIT.
Para poder usar cenote-taker3 una vez logueado en drago.csic.es tendrá que cargar los siguientes módulos en mismo orden.
module load rama0.4
module load cenote-taker3/3.4.4